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CY5-4-巯基尿苷,CY5-4-Thiouridine,RNA研究中的多功能硫修饰核苷的荧光探索

2026年05月18日 22:45
 

物理化学特性

光谱特征:在pH 7.0水溶液中,最大吸收波长约331 nm(ε ≈ 21,000 M⁻¹cm⁻¹),该吸收源于n-π*跃迁,常用于浓度定量。

反应性:巯基/硫酮基具有亲核性,易与烷基化试剂(如碘乙酰胺)或马来酰亚胺发生加成反应,也可在UV 365 nm照射下与邻近碱基交联。

稳定性:对酸敏感,强酸中糖苷键易水解;硫原子易被氧化为亚砜,需避光冷藏保存。

功能应用

tRNA结构稳定剂:在细菌tRNA中作为保守修饰,通过增强碱基堆积力稳定L形三级结构,提高翻译准确性。

RNA光交联探针:将s⁴U掺入RNA后,紫外照射可使其与结合蛋白质形成共价交联,用于绘制RNA-蛋白质相互作用图谱(如PAR-CLIP技术)。

代谢标记工具:在细胞培养中利用4-硫代尿苷(s⁴U)脉冲标记新生RNA,通过生物素-马来酰亚胺偶联纯化,分析转录组动态(如SLAM-seq)。

实验反应示例